Nacional de Montevideo es el rival en octavos, para tratar de defender la Copa Sudamericana ganada en las dos ediciones anteriores. Un mal partido en Montevideo y un difícil triunfo en la revancha ponen la definición en los penales, en los que los uruguayos tuvieron más puntería y dejaron eliminado al conjunto boquense.
| Día | Partido | Resultado | Estadio | C | |
|---|---|---|---|---|---|
| 28/09/2006 | Octavos de Final. Partido de Ida | Nacional (Uru) 2 - Boca 1
 28/09/2006 |
Centenario (Montevideo) | V | |
| 12/10/2006 | Octavos de Final. Partido de Vuelta | Boca 2 (1) - Nacional (Uru) 1 (3)
 12/10/2006 |
Padre Ernesto Martearena (Salta) | L |
Boca ganó: 1 (50.00%)
Empató: 0 (0.00%)
Perdió: 1 (50.00%)
Goles convertidos: 3 (1.50)
Goles recibidos: 3 (1.50)
Total Partidos: 2 (50.00%)
| Jugador | Partidos | Goles |
|---|---|---|
Palacio, Rodrigo Sebastián
 Partidos jugados por Rodrigo Sebastián Palacio en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 2 |
Bertolo, Nicolás Santiago
 Partidos jugados por Nicolás Santiago Bertolo en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 1 |
Bobadilla, Aldo Antonio
 Partidos jugados por Aldo Antonio Bobadilla en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Cardozo, Neri Raúl
 Partidos jugados por Neri Raúl Cardozo en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Díaz, Daniel Alberto
 Partidos jugados por Daniel Alberto Díaz en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Krupoviesa, Juan Angel
 Partidos jugados por Juan Angel Krupoviesa en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Ledesma, Pablo Martín
 Partidos jugados por Pablo Martín Ledesma en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Morel Rodríguez, Claudio Marcelo
 Partidos jugados por Claudio Marcelo Morel Rodríguez en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Silvestre, Matías Agustín
 Partidos jugados por Matías Agustín Silvestre en Copa Sudamericana 2006 |
2 | 0 |
Barros Schelotto, Guillermo
 Partidos jugados por Guillermo Barros Schelotto en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Boselli, Mauro
 Partidos jugados por Mauro Boselli en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Dátolo, Jesús Alberto
 Partidos jugados por Jesús Alberto Dátolo en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Franzoia, Andrés
 Partidos jugados por Andrés Franzoia en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Gago, Fernando Rubén
 Partidos jugados por Fernando Rubén Gago en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Ibarra, Hugo Benjamín
 Partidos jugados por Hugo Benjamín Ibarra en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Maidana, Jonathan Ramón
 Partidos jugados por Jonathan Ramón Maidana en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Palermo, Martín
 Partidos jugados por Martín Palermo en Copa Sudamericana 2006 |
1 | 0 |
Jugadores utilizados: 17
| Director Técnico | Partidos |
|---|---|
La Volpe, Ricardo Antonio
 Partidos dirigidos por Ricardo Antonio La Volpe en Copa Sudamericana 2006 |
2 |
